主将和副将的搭配直接影响战斗效果。主将的天赋和技能全部生效，而副将仅技能生效，天赋不触发。选择主将时优先看兵种加成和天赋强度，副将则侧重技能互补。主将需达到三星以上才能解锁副将位置，且主将等级至少20级才可配置副将。合理搭配能让队伍实力大幅提升，尤其在野战、集结和驻防时效果显著。
不同统帅对步兵、骑兵、弓兵等有专属加成，实战中应优先选择对应兵种加成最高的主将。副将虽然不触发天赋，但能携带不同兵种，补充主将的短板。例如主将擅长骑兵冲锋，副将可搭配弓兵远程支援。注意主副将的兵种混搭需符合战术需求，避免属性冲突。研究科技等级越高，兵种加成的收益越明显，因此后期需根据兵种科技调整搭配。
主将的大招先释放，副将技能随后触发，因此副将的技能最好能强化主将效果或弥补缺陷。例如主将主打爆发伤害，副将可选择带治疗或减伤的技能；若主将偏防御，副将可补充群体伤害技能。部分金色武将作为副将时技能效果减半，需谨慎评估是否值得投入资源。技能组合的合理性比单纯追求高稀有度更重要。
主将的天赋点满后能大幅提升部队属性，例如骑兵机动性、步兵防御力等，而副将的天赋点再高也不会生效。因此培养主将时应优先点满攻击或防御类天赋，副将则无需浪费天赋书。驻防时主将必须选择触发驻防天赋的统帅，副将仅提供技能支持。日常采集或打野时，可将天赋点满采集类的武将设为副将，节省主将体力。
后期玩法中，主副将搭配需随版本更新调整。新武将往往拥有更适配当前环境的技能机制，及时替换过时的组合能保持竞争力。平民玩家可专注培养紫将或易获取的金将，如孙武、贞德等，通过技能互补弥补属性差距。集结作战时，队伍属性以发起者的主将科技为准，因此加入集结前需确认自身副将技能是否能配合主力输出。前期优先培养一队通用组合，中后期再针对不同玩法细化搭配。资源有限时，集中强化主将的天赋和等级，副将觉醒即可满足需求。多观察战区主流阵容，逐步优化自己的战术体系。
