编队是战斗力的核心体现，合理的编队构建直接影响战局走向。首先需要明确编队的基本逻辑：一支编队通常由五名角色组成，包括一名舰长和四名舰员。舰长的选择至关重要，攻击型舰长可提升全队输出，防御型舰长则能提供额外防护。某些舰长还拥有特殊被动技能，如增加全队躲避率或减伤效果。编队组建需通过游戏主界面的编队按钮进入列表界面，选择新增编队并逐步填充成员。
一支完整的战斗体系应包含攻击、防守、控制和治疗等多种角色。部分角色技能可提供护盾或治疗，另一些则能增强全队攻击力。站位调整也是关键环节，前排角色更易承受敌方火力，因此防御较强的角色应优先放置在前排，而防御较弱或依赖技能输出的角色适合后排。这种布局能最大化利用角色特性，避免因站位不合理导致战斗效率下降。
每艘战舰的武器系统均可改造，蓝图通常包含5-7个配件系统供玩家定制。攻击型角色应优先配备提升攻击力的装备，控制型角色则需侧重技能减益效果增强。装备属性需与角色职业和技能契合，例如载机型舰船可携带护航艇以增强对中型舰的打击能力。通过科研基地的专项研究，还能解锁更高级的舰船模块，进一步提升编队综合实力。
实战中需根据敌方配置动态调整编队策略。若敌方以航母为主力，可编入防空型舰船或搭载防空战机的母舰；若需快速突袭，则优先选择高移速护卫舰组成机动小队。编队命名也有战术价值，可通过误导性名称迷惑对手。增援功能可突破指挥值限制，但需注意增援后舰队将转为普通航行模式，因此需提前规划行动路径。
